Вероятно, размер загружаемого файла слишком велик. Способы обхода данного ограничения описаны в документации.

быстрый выход пробовать запаковать файл в zip с именем {имя файла}.sql.zip открываем файл  /etc/phpmyadmin/apache.conf
sudo vim /etc/phpmyadmin/apache.conf

в секцию <IfModule mod_php5.c>

вставляем строки

                php_admin_flag upload_max_filesize 100000
                php_admin_flag post_max_size 100000

перезапускаем apache

sudo /etc/init.d/apache restart